病毒RNA提取纯化试剂是于血清(血浆)等液体样品中提取病毒RNA的纯化试剂。
实验操作:
1.如果有N个样品,标记N+2个1.5-2mL螺旋盖塑料离心管,多出的一个为阳性对照,一个为阴性对照。为避免污染,建议不要使用压盖式塑料离心管。在每个管上做个标记,以在后续操作时区别向心面和离心面。
2.在离心管中分别加入0.2mL液体样品(血清、血浆、尿液、脑脊液、唾液、眼泪等等),阳性对照和阴性对照。
如果是口腔拭子、咽喉拭子等各种拭子样品,则将拭子放入0.2mL自备生理盐水中挤压出液体,然后取0.2mL进行提取。
如果是粪便等半固定样品,则取约0.3mL的样品,加入0.3自备生理盐水,震荡重悬,离心取0.2mL上清进行提取。
如果血液,细胞培养液等含细胞的液体,可以离心用上清,也可以直接取用,但后者提取的RNA中有细胞的基因组DNA污染。血浆的抗凝剂必须是EDTA或ACD,不能是肝素。使用ACD时由于所加入ACD会增加体积,样品会被稀释,得到的病毒滴度会比使用 EDTA低15%左右。血浆按0.6mL/管的量分装保存,以避免反复冻融。
如果样品是实体组织或培养细胞,则需要在自备生理盐水中匀浆后离心,用0.2mL上清液(含病毒)进行提取,但此种情况下后得到的RNA不可避免的会含有基因组DNA 污染。
如果液体样品中的病毒需要富集,可以使用1.5mL上述方法得到的液体在4℃24000g 冷冻离心60分钟,移弃1.3mL、用剩下的0.2mL继续操作。
3.在每个离心管中加入0.6mL RNA病毒裂解液。RNA病毒裂解液在低温放置会产生结晶沉淀,需提前65℃水浴溶解并充分摇匀后取用。
4.室温放置10分钟裂解病毒。
5.振荡数秒后加入0.7mL室温异丙醇,旋紧盖后振荡30秒混匀,把离心管的向心面对向转头的中央,13000-15000g室温离心至少15分钟。
6.小心移弃上清,注意不要触及管底和管壁离心面的RNA沉淀(此时可能看不见)。
7.加入1.0mL室温70%乙醇,振荡数秒后15000g室温离心5分钟。注意:在离心机中放置离心管时将其向心面对向转头的中央。
8.小心移弃上清,注意不要触及管底和管壁离心面的RNA沉淀(此时呈膜状沉淀)。
9.再短暂离心数秒,用移液器移弃残留液体(70%乙醇),否则它会影响后续反应。
10.加入200μl RNase-free水或1×液相RNase Erasol(能灭活残留的RNase,而 RNase-free水无此功能),用移液枪仔细吹打离心管管底和管壁离心面的膜状RNA沉淀,溶液将呈混浊状,含少量不溶物。由于不溶沉淀物中含有RNA,所以不要离心后取上清使用,必须取混合液使用,哪怕很浑浊。
11.直接取适量用于RT-PCR,如果溶于200uL水,同时样品使用量不超过RT-PCR体系的 1/2,不溶物一般不会影响RT-PCR。剩余样品可以室温放置2小时,也可保存于-80℃保存一个月。